Los Angeles. Jest rok 2029. Na świecie panuje chaos i zagłada. Wszelkie zło rozpętane przez podmuch wojny powołało do istnienia pewną rasę zwaną "Omega"-ludzie cyborgi, pozostawione same sobie zaczęły się buntować przeciwko całemu systemowi panującemu na ziemi. W celu zniszczenia elektronicznego wroga, została wprowadzona procedura o nazwie "Prototyp". Akcja eksterminacji komplikuje się jednak gdy jeden z mężczyzn będący Prototypem odkrywa po czasie że jego ukochana jest tak naprawdę Omegą...

W połowie 21 wieku wielkie miasta rozpadają się w gruzy. Z celu przejęcia kontroli i wyeliminowania całej ludzkości stworzone zostały istoty ludzkie z wbudowanym układem cybernetycznym. Nazwano je Omegami. Gdy Omegi zaczęły zmieniać swe oprogramowanie, wprowadzono Prototypy - nowe, w pełni cybernetyczne istoty. Miały wbudowany tylko jeden program: zniszczyć jednostki Omega. Sparaliżowany żołnierz Hawkins decyduje poddać się przemianie w Protektora, aby odzyskać władzę w nogach. Zbyt późno odkrywa, że kobieta którą kochał jest Omegą.